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流行疫病成因入秋后，由于白天气温持续高温，晚上气温骤降，昼夜温差较大，容易对生猪造成应激;或经历过高温高热，生猪免疫系统曾受高温损害，生猪免疫力下降，部分生猪仍然处于病毒排毒期，一时难以恢复健康造成隐患;或因为猪场消毒工作不到位，保健措施不当，不能有效杀灭病原微生物，导致生猪没有足够的抗病能力;由于管理不当，或养殖户对生猪需水量不了解，饮水设备不清洁，污染水源导致生猪感染疾病;或忽略了饲料中霉菌毒素的影响，使生猪误食了霉变食料;有些自制配方饲料的养猪场没有根据气候变化及时调整饲料配方，使生猪生长阶段与营养供给不匹配导致免疫力下降。
试验期间，以圈为单位记录采食量。试验结束时空腹称重，记录猪只末重，计算平均日增重（ADG）、平均日采食量（ADFI）、料重比（F/G）。试验结束当天上午8：00，以圈为单位采集猪新鲜排泄的粪便，使用无菌勺掰开粪便，取未沾到地面的中心部分，放到无菌封口袋中，收集半袋后混匀，一部分分装于EP管中，-80℃保存，用于粪便菌落多样性检测和分析；另一部分分装于50mL离心管，放置于冰盒中，运回实验室后立即处理样品，测定吲哚、3-甲基吲哚、对甲酚以及挥发性脂肪酸（VFA）含量。
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